如何解决医药分析中的重复测量问题

shenweis

Mujahida 发表于 2014-6-1 18:27
对，这是多元，多个Y：1h,2h,4h,6h,8h
我不能将胶囊、片剂说成是二元，用英文表述是： two-way repeated ...

这里的片剂和胶囊应理解为一个因子的两个水平，即因子为剂型，两个水平分别为片剂和胶囊。

Mujahida

这里的双因子与传统的双因子是不一样的：
1. 重复测量(repeated measure)是一个时间因子；
2. 胶囊和片剂是在这个试验中是between-subject，将参与者分成了两组，可认为是另一种因子；
所以一种混合设计(mixed-design).
如果只用一种药物进行重复测，用Fit model,只有一个时间因子，1h,2h,4h,6h,8h都是Y，没有模型效应因子；
如果有胶囊、片剂进行重复测量，用Fit Model, 1h,2h,4h,6h,8h都是Y， 模型效应因子是“剂量”（between subjects).
所以<<JMP for basic univariate and multivariate statistic>>书中第11章与第12章在这方面分别作了特别的说明。

我对球形检验的理解是：球形检验实质，类似于方差齐性（Homogeneity)检验，是在同一种处理下，各时间点的测量结果，其方差齐性。如果在不同的处理，homogeneity同质性也就没有意义。

shenweis

Mujahida 发表于 2014-6-1 20:20
这里的双因子与传统的双因子是不一样的：
1. 重复测量(repeated measure)是一个时间因子；
2. 胶囊和片剂 ...

本例资料涉及2个实验因素，即“剂型”和“时间”，前者与重复测量无关，是一个剂型分类的因素，它有“片剂”和“胶囊“2个水平，后者与重复测量有关，为重复测量因素，有5个水平，资料所对应的实验设计类型为具有一个重复测量的两因素设计。该资料只涉及一个定量的观测指标，故资料属于有一个重复测量的两因素设计一元定量资料。故采用具有一个重复测量的两因素设计定量资料的一元方差分析。

对于这种一元定量资料，本质是一元，但为什么要把测自不同时间点上的数据看成是多元的呢？因为同一行上的数据重复测自同一个受试对象，它们之间往往有较高的相关性。为了有效地处理重复测量数据间的相关性，GLM过程使用了特定模型的多元方法。

若使用一元分析方法，资料必须满足特定类型的协方差矩阵，是否满足，可进行球性检验。

另外，JMP的防错机制，不可能在错误的条件下仍给出球性检验的结果。

Data

厉害！

Mujahida

我的分析步骤如下：
1. 构建模型:

2. 点击Run,可得到如下结果，因为球检验已经没有意义，所以，不要选"univariate test also",而只选"test each column separeately also"

3. Choose response>repeated measure, 出现如下对话框，因为球形检验已经没有意义，不要选"Univariate test also",

4. 点击“OK”，可得如下详细结果报告，这个报告中，也就没有“球形检验”的相关结论出现，

我相信JMP是有很好的fool-proof功能，但是，其前提我们必须了解其相关分析的步骤，不能给JMP一些错误的输入。

Mujahida

5.从上述报告可以看出,"剂量*time"没有显著的交互作用，但是，胶囊比片剂效果显著，Prob> F, <0.001 under Intercept .

shenweis

Mujahida 发表于 2014-6-2 20:15
我的分析步骤如下：
1. 构建模型:

为什么先确定球形检验没有意义呢？

Mujahida

球形检验是对单因子方差齐性的检验(Homogeneity of covariance)，而这里包含一个混合设计，
1.重复测量的 时间效
2. between-subject factors, 胶囊、片剂
我们可以这样理解：因为一个因子的最大空间变化是一个球，那么，两个因子的作用，就很难是一个球形；
另外，球形检验在一个因子的同一个水平下，实验的参与者，也必须大于20+水平数时,才有可参考的价值,否则,也是没有多大的意义.

Jerry96

这应该是：具有一个重复测量的两因素设计定量资料的方差分析。一个重复测量是指血药浓度，两因素指的是药物剂型和时间。

Jerry96

请教一下如何解决二个重复测量的两因素设计定量资料的方差分析问题？
例：某医生向评价一种新的食谱对具有家族遗传性心脏病患者的作用。16名患者进行了6个月的饮食实验，实验指标为体重和三酰甘油水平，并在实验过程中重复了5次。研究者想知道在实验过程中患者的体重和三酰甘油水平是否有变化                                                                                       
patid        gender        tg0        tg1        tg2        tg3        tg4        wgt0        wgt1        wgt2        wgt3        wgt4
1        0        180        148        106        113        100        198        196        193        188        192
2        0        139        94        119        75        92        237        233        232        228        225
3        0        152        185        86        149        118        233        231        229        228        226
4        1        112        145        136        149        82        179        181        177        174        172
5        0        156        104        157        79        97        219        217        215        213        214
6        1        167        138        88        107        171        169        166        165        162        161
7        0        138        132        146        143        132        222        219        215        215        210
8        1        160        128        150        118        123        167        167        166        162        161
9        0        107        120        129        195        174        199        200        196        196        193
10        0        156        103        126        135        92        233        229        229        229        226
11        1        94        144        114        114        121        179        181        176        173        173
12        1        107        93        156        148        150        158        153        155        155        154
13        1        145        107        129        86        159        157        151        150        145        143
14        0        186        142        128        122        101        216        213        210        210        206
15        0        112        107        103        89        148        257        255        254        252        249
16        1        104        103        117        79        130        151        146        144        144        140